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根據經驗，可以遵循以下幾個選購原則，相對應即可。
怎樣選擇適合的純水機？
1．實驗內容
分無機實驗和有機實驗，無機實驗只需電阻大于18兆歐的水質就行，而有機實驗則通常要去除水中的有機物質，所以除了電阻大于18兆歐以外，還需要有機碳的指標。如果是生物方面的實驗，要去除水中的細菌。
2．儀器種類
客戶可以根據使用的儀器種類來選擇國產實驗室超純水機。液相用水的電阻大于18兆歐；并且要去除有機物；原子吸收、原子熒光及環境監測儀器用水大于18兆歐就行；PCR等生命科學儀器用水除了電阻大于18兆歐以外，還需除菌，除有機物，除熱源。
3．目前用水來源
如果客戶目前的用水是合格的，也可以將該純水的來源方式告知國產實驗室超純水機廠商，其技術人員會根據該情況來推薦相應的規格型號。
以上三種原則是根據實際的應用經驗得來的，可以參考，但是最準確的型號選擇還是盡量提供詳細的水質參數，如電阻、微量元素、細菌、總有機碳水平等。
客戶在選購超純水機時一定要向廠商提供原水的水質狀況，比如泥沙多，硬度高，地下水等情況，國產實驗室超純水機的工藝是根據原水水質的好壞來確定的，泥沙多，要添加預處理裝置，硬度高，要添加軟化裝置，含鹽量高，要采用二級反滲透工藝等。如果選用以純水為水源的超純水機，則只需要提供水質需求和用水量就可以了。
除此之外，通常我們還要考慮到以下幾個因素：
（1）水質監控
水質監控是產水品質的重要保證。高品質的純水儀器必須包括實時在線的電導率（電阻率）檢測儀和溫度監測。目前利用高精度的電導率儀（或電阻率儀）來測定超純水的離子水平已經成為了超純水器的標準配置。這里要注意的是，因為要測定的電導率值非常低（電阻率很大），所以一定要留意電導率儀的精度是不是能達到要求，一般要求電導率儀的電池常數 0.01 cm-1（參加GB/T6682相關要求）。并可準確顯示溫度補償的電阻率。同時還要具有水質不合格自動報警功能，可以根據用戶的實際需要更改水質報警參數。
（2）微生物（細菌）指標
微生物污染是常常會被忽略的一個問題，微生物污染一旦出現，將會迅速遍及到整個國產實驗室超純水系統，并且逐漸形成菌膜，很難去除。它們不斷向水中釋放有機物和離子，造成純水的二次污染。使用這樣的水進行實驗，會對實驗結果有很大的影響。如進行離子色譜和高效液相分析時出現鬼峰。
為了防止微生物的污染，我們應該選擇無死體積、采用循環管路、帶有紫外殺菌器、終端除菌過濾器的國產實驗室超純水設備，可以最大程度抑制微生物在系統內的生長和增殖。
（3）使用簡單、便捷
一個儀器使用是否方便是衡量一個儀器好壞的重要標志。很多時候我們希望儀器使用起來就像傻瓜相機一樣簡單方便：簡單明了的操作界面，沒有過于復雜的控制系統，沒有太多的參數設置。而對于純水機來說，衡量它使用方便與否，就看該國產實驗室超純水儀器能否讓操作人員只操作取水鍵，而不需其它額外的操作。
（4）維護方便
純水機中所使用的離子交換樹脂，活性炭，終端過濾等過濾柱都是有一定的使用壽命的，我們需要對其進行定期更換，才能確保水質達標。很多人認為離子交換樹脂是可以不斷再生，循環使用，其實不然。過期或再生的樹脂會向水中釋放出高濃度的污染物，再生樹脂重復使用也會導致樹脂顆粒的破損，向水中釋放出顆粒和有機物，加速微生物的生長。所以儀器本身自帶的預警功能非常重要，它可以在耗材耗竭，水質徹底變壞以前，提醒您準備更換耗材。
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